
近日,青岛农业大学园艺学院在Horticulture Research期刊上发表题为“Genome-Wide Association Study and Functional Validation of CsAGD6 Conferring Drought Tolerance in Tea Plant”的研究成果。青岛农业大学硕士生岳佳璇与已毕业硕士何珊为论文共同第一作者股票配资行情,钱文俊副教授与丁兆堂教授为共同通讯作者。
该研究通过对115份茶树种质资源进行11项生理指标测定,结合主成分分析与隶属函数法构建了综合抗旱指数(D值)。基于全基因组重测序数据,利用线性混合模型开展GWAS分析,共鉴定到67个与抗旱性状显著相关的SNP位点,并在其50 kb上下游区域内筛选出4个候选基因,其中包括位于10号染色体的CsNHX1与CsAGD6,以及位于7号染色体的两个抗病相关基因。

图1 茶树抗旱性状的全基因组关联分析
进一步研究表明,CsAGD6编码一个定位于细胞核的ADP-核糖基化因子GTP酶激活蛋白。功能验证显示,沉默CsAGD6会导致丙二醛含量上升、含量与Fv/Fm下降,加重氧化损伤并削弱光合能力;而过表达该基因则能增强膜稳定性与光合效率,有效提升抗旱性。单倍型分析发现,CsAGD6启动子区存在8种单倍型,编码区存在5种单倍型。其中Hap-P1和Hap-C1为优异单倍型,与茶树抗旱性显著相关。
此外,研究团队基于CsAGD6外显子区chr10:206216541(C/T)位点开发了一个SNP-KASP分子标记。该标记可有效区分不同基因型,其中CC型材料表现出更强的抗旱性,为抗旱茶树种质的高通量筛选提供了高效、可靠的技术手段。

SNP-KASP标记开发
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